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研究平台

　　

基因所计算平台，以实现大规模农业生物信息学计算为中心任务，推动形成农业海量生物组学大数据储存、整合与挖掘研究体系，为实现农业生物大数据的深度挖掘奠定基�。猿愫痛笫萘礁鲋行耐贫Э平ㄉ�，目前平台计算能力500TFLops，存储能力16PB，以CPU计算为主，部署有Intel、国产arm架构，核心总数超过15000余颗。平台正在筹建新一期超算集群，到2024年，平台CPU计算能力将达到1500TFlops，存储能力40PB。



建设历程：


建设时间

CPU算力

GPU算力

存储能力

资金来源

2014年5月

35T

1P

自筹经费

2016年7月

15T

1.5P

深圳市农业表型和利用重点实验室

2019年4月

10T

3P

自筹经费

2020年4月

90T

0.5P

自筹经费

2021年9月

350T

150T

10P

深圳市基础研究机构


功能特点：

（1） 平台计算资源呈梯子配置， 6T、3T、2T等大内存节点分区可满足复杂基因组组装需求；普通节点分区可满足基因数据和表型数据分析等诸多应用。

（2） 平台同步提供AI算力，提供了最主流的TensorFlow、Caffe、Pytorch等AI人工深度学习算法框架，可以应对众多复杂的人工智能挑战。

（3） 平台拥有国产CPU芯片（华为鲲鹏ARM架构）服务器40余台，已实现迁移部署常用生物信息软件50余款。

（4） 平台拥有Sentieon和人和未来gtx基因数据分析软件资源，针对BWA+GATK等分析流程加速效果显著。

（5） 平台拥有高性价比AMD、国产海光等CPU架构的外部计算资源作为补充，可满足上万核的并发任务。


开放共享：

计算平台实行开放式共享原则，实行独立核算，建立成本核算和服务收费管理机制，为院所内外各单位生物学研究提供集群建设和支持、数据分析、生物信息数据库开发、高性能计算、计算加速和海量存储服务。

联系方式： [email protected]


计算平台更新于2023年7月



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