陈绮翩课题组
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姓名： |
陈绮翩 |
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职称： |
副研究员 |
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研究方向： |
主要从事群体遗传学，基因组学以及分子演化等研究方向上的研究 |
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简历介绍：
陈绮翩，现任中国农业科学院深圳农业基因组研究所副研究员。
2014年9月-2021年12月在中山大学攻读植物学博士学位。主要从事群体遗传学，基因组学以及分子演化等研究方向上的研究。基于多物种的基因组数据，结合比较基因组学、群体遗传学、计算生物学等方法，研究群体动态历史和分子序列演化的适应性信号。目前已发表SCI论文6篇，其中以第一作者（含共一）身份在National Science Review和Nature Ecology & Evolution期刊发表论文共2篇。其他参与作者成果发表在National Science Review、New Phytologist 、BMC Plant Biology等期刊上。
工作经历：
2022/05 -至今 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 副研究员
2022/01-2022/04 中山大学生命科学学院 科研助理
教育经历：
2014/08-2021/12 中山大学生命科学学院 植物学 博士研究生
2010/08-2014/06 中山大学生命科学学院 生物技术 本科
研究领域：
团队组成：
陈绮翩 (课题组长), 联系方式：[email protected]
黄珠清 (科研助理), 联系方式：huangzhuqing@caas.cn
陈绮翩(左三)课题组合影
研究方向：
检测适应性演化的方法学、人工选择和自然选择下种群的演化规律。
研究进展：
如何在多物种的基因组序列上检测适应性演化是分子演化领域的一个重要科学问题。蛋白编码基因上的序列演化由遗传漂变和自然选择两种力量同时驱动，如何在考虑多种驱动力的作用因素下量化正选择的相对贡献是分子演化研究一个难点。我们致力于发展一个基于物种群体历史对正负选择强度做系统性检测的新方法。
代表论著：
代表论文：
1. Chen, Qipian, H. Yang, X. Feng, Qingjian Chen, S. Shi*, C-I. Wu*, Z. He*. 2022. Two decades of suspect evidence for adaptive molecular evolution — negative selection confounding positive selection signals. National Science Review, 9:nwab217.
2. He, Z.#, X. Feng#, Q. Chen#, L. Li#, S. Li, K. Han, Z. Guo, J. Wang, M. Liu, C. Shi, S. Xu, S. Shao, X. Liu, X. Mao, W. Xie, X. Wang, R. Zhang, G. Li, W. Wu, Z. Zheng, C. Zhong, N. Duke, D. Boufford, G. Fan, C-I. Wu, R. Ricklef, S. Shi*. 2022. Evolution of coastal forests based on a full set of mangrove genomes. Nature Ecology & Evolution, 6:738–749 (#co-first author).
3. Xinfeng Wang; Ziwen He; Zixiao Guo; Ming Yang; Shaohua Xu; Qipian Chen; Shao Shao; Sen Li; Cairong Zhong; Norman C Duke; Suhua Shi. 2022. Extensive gene flow in secondary sympatry after allopatric speciation. National Science Review, 9(12): nwac280.
4. Xiao Feng; Guohong Li; Shaohua Xu; Weihong Wu; Qipian Chen; Shao Shao; Min Liu; Nan Wang; Cairong Zhong; Ziwen He; Suhua Shi. 2021. Genomic insights into molecular adaptation to intertidal environments in the mangrove Aegiceras corniculatum. New Phytologist, 231(6): 2346-2358.
5. Feng Xiao; Xu Shaohua; Li Jianfang; Yang Yuchen; Chen Qipian; Lyu Haomin; Zhong Cairong; He Ziwen; Shi Suhua. 2020. Molecular adaptation to salinity fluctuation in tropical intertidal environments of a mangrove tree Sonneratia alba. BMC PLANT BIOLOGY, 20: 178.
6. J. Li, Y. Yang, Q. Chen, L. Fang, Z. He, W. Guo, S. Qiao, Z. Wang, M. Guo, C. Zhong, R. Zhou*, S. Shi*. 2016. Pronounced genetic differentiation and recent secondary contact in the mangrove tree Lumnitzera racemosa revealed by population genomic analyses. Scientific Reports, 6: 29486.
陈绮翩课题组更新于2023年9月