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邵浩靖

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邵浩靖,副研究员,深圳市海外高层次人才。2018年博士毕业于澳大利亚昆士兰大学,研究方向为针对DNA测序数据数据的生物信息方法开发和分析,开发了npInv和SOAP-popIndel等算法软件。近年来使用自主研发的方法或现有方法对基因组变异进行研究,其结果作为成果的一部分发表到高水平学术期刊,获得引用共计6000余次并以第一作者在Nucleic Acids Research, Scientific Report, BMC Bioinformatics上发表学术论文3篇。

工作经历

2020.8–至今          中国农业科学院深圳农业基因组研究所     副研究员

2018.9–2020.6      昆士兰大学                                             博士后  

2009.3–2013.12    华大基因                                                课题组长

教育经历

2014.1–2018.8                昆士兰大学        博士

2006.9–2010.6                华南理工大学    学士    

研究方向:

目前本课题组致力于空间转录组学研究。利用空间基因表达解决策略测量完整组织切片的总mRNA,将总mRNA的空间信息与形态学内容相结合,并绘制所有基因表达发生的位置,获得复杂而完整的基因表达图谱。利用不同基因、细胞群的空间位置探究基因及细胞功能、表型和组织微环境、发育等生物学问题,并构建3D转录组模型。此外,本课题组也致力于用信息分析的方法对基因组进行探索。目前大部分动物植物的基因组已经到达染色体水平,但是还没有到达100%完整的端粒到端粒水平。未知的序列主要是串联重复序列(着丝点或核糖体)或者是大片段重复序列。本课题组结合二代,三代,HiC等测序数据开发方法对这些基因组未知区域进行探索,并对其进行分析。

主要讲授课程:生物信息学方法——序列比对。